Al presionar el botón Aplicar cambia la imputación siempre al comprobante por el más viejo y añade nuevos si el monto es mayor. Para evitar esto lo haremos de la siguiente forma:
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En este ejemplo seleccionamos un comprobante que no es el más viejo.
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En la celda Imputación lo cambiamos a $400, la mitad, presionamos Enter y luego le damos a Aceptar.
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Cuando seleccione los fondos le quedará esos $400 para pagar, como en la última imagen
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