Para ello hay que ir a Tesorería -> Imputaciones -> Comprobantes de Venta
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Una vez dentro buscamos el cliente y le damos a Generar Comprobante
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Buscamos la nota de crédito o factura, la seleccionamos y le damos a Imputar
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Seleccionamos las que queremos borrar y pulsamos Quitar. Una vez borradas le damos a Guardar
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Listo, ahí se borraron las imputaciones deseadas