Para ello hay que ir a Tesorería -> Imputaciones -> Comprobantes de Venta
Una vez dentro buscamos el cliente y le damos a Generar Comprobante
Buscamos la nota de crédito o factura, la seleccionamos y le damos a Imputar
Seleccionamos las que queremos borrar y pulsamos Quitar. Una vez borradas le damos a Guardar
Listo, ahí se borraron las imputaciones deseadas